Новая сайт-специфическая эндонуклеаза рестрикции AlsI из Aquipseudomonas alcaligenes 51 узнает октануклеотидную палиндромную последовательность ДНК 5’-TTT^TAAAA-3’
М.А. Абдурашитов1*, В.С. Дедков1, В.А. Чернухин1, Д.А. Гончар1, Н.А. Михненкова1, Н.А. Воронцова1, С.Х. Дегтярёв1
1 ООО «СибЭнзайм», Новосибирск
* автор для переписки: М.А. Абдурашитов, ООО «СибЭнзайм», ул. Тимакова, д. 2/12, Новосибирск, 630117, Россия; тел.: +7 (383) 333-4991; факс: +7 (383) 333-6853; E-mail: abd@sibenzyme.ru
РЕЗЮМЕ. Нами выявлен бактериальный штамм Aquipseudomonas alcaligenes 51, который является продуцентом новой крупнощепящей эндонуклеазы рестрикции, названной AlsI. Фермент AlsI узнает восьминуклеотидную палиндромную последовательность ДНК 5’-TTT^TAAAA-3’ и расщепляет её после третьего тимина с образованием 5’-выступающих TA-концов, совместимых с концами Tru9I (5’-T^TAA-3’) и VspI (5’-AT^TAAT-3’). AlsI является новым прототипом — ферментов с сайтом 5’-TTTTAAAA-3’ ранее не описано. Штамм-продуцент идентифицирован по морфологическим и биохимическим признакам и по анализу фрагмента гена 16S рРНК. Препарат AlsI (1000 е.а./мл) получен в три…